More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0413 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0413  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  860    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.774669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  98.07 
 
 		 415 aa  848    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  99.03 
 
 		 415 aa  855    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 416 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  57.74 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 413 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 422 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  56.3 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  56.3 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 414 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 413 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 412 aa  484  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 415 aa  481  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 410 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 438 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 412 aa  474  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  57.53 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  54.3 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  53.17 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.28 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  56.27 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 		 424 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  56.27 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  55.39 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 423 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  56.27 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  56.79 
 
 		 419 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  56.05 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>