64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0599 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 174 aa  346  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  24.76 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  23.46 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  33.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07740  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.339553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  21.83 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 159 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 144 aa  42  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 153 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  25.83 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 169 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 220 aa  41.6  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  28.07 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  21.59 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  30.77 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>