50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1874 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  97.87 
 
 		 469 aa  942    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  97.01 
 
 		 469 aa  932    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  956    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  33.67 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  33.27 
 
 		 503 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  28.76 
 
 		 833 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  28.52 
 
 		 677 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  26.94 
 
 		 986 aa  96.3  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  28.62 
 
 		 692 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1008 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  26.04 
 
 		 843 aa  93.2  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1183 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1168 aa  90.1  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1088 aa  90.1  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  29 
 
 		 644 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1101 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  27.96 
 
 		 650 aa  80.5  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1203 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1080 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  24.62 
 
 		 854 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  30.68 
 
 		 653 aa  77.4  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  26.26 
 
 		 957 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  29.41 
 
 		 650 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  28.06 
 
 		 649 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1119 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  26.74 
 
 		 833 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1744 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  26.37 
 
 		 730 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  28.11 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  26.38 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  28.42 
 
 		 676 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  26.41 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  28.61 
 
 		 796 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  26.54 
 
 		 651 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  33.96 
 
 		 676 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  25.9 
 
 		 814 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  25.79 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1030 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  25.22 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  26.79 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  24.67 
 
 		 647 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  26.22 
 
 		 939 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  31.36 
 
 		 773 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  25.29 
 
 		 760 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  28.16 
 
 		 785 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1140  hypothetical protein  40.24 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1746  hypothetical protein  40.51 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.681924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  24.24 
 
 		 289 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2553  hypothetical protein  36.59 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  20.21 
 
 		 1332 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>