More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3064 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3064  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 449 aa  929    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2477  aminotransferase, class I and II  42.79 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.055447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4591  putative transcriptional regulator, GntR family  40.24 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2660  GntR family transcriptional regulator  40.9 
 
 		 439 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220468  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3266  putative transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1742  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2452  aminotransferase, class I and II  38.8 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  30.33 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 400 aa  173  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  31.9 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 399 aa  169  7e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 409 aa  169  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  30.02 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 402 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  30.57 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  29.81 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  30.83 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  29.14 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 438 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  28.68 
 
 		 397 aa  156  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  30.32 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  29.56 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  29.37 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  29.01 
 
 		 446 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 395 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  29.61 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  29.61 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  30.77 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  30.48 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  29.79 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 397 aa  150  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  29.83 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  29.93 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  28.64 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  30.17 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  30.17 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  27.61 
 
 		 401 aa  146  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5545  putative transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.97296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1763  aminotransferase, class I and II  30.46 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59119  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  29.83 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 411 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  30.5 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  26.63 
 
 		 433 aa  143  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  29.98 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  29.98 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  29.98 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  29.98 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  29.98 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  29.98 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.04 
 
 		 498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  31.22 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  28.16 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  27.38 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  26.59 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 441 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  25.69 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  23.17 
 
 		 396 aa  136  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>