More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3008 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  64.7 
 
 
962 aa  1270    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.730606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  60.46 
 
 
962 aa  1224    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  60.38 
 
 
962 aa  1213    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  60.38 
 
 
962 aa  1213    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  60.38 
 
 
962 aa  1213    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  60.1 
 
 
962 aa  1207    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  77.09 
 
 
967 aa  1555    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  60.1 
 
 
962 aa  1222    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  60.21 
 
 
962 aa  1223    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  60.17 
 
 
962 aa  1209    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  60.38 
 
 
962 aa  1213    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  100 
 
 
981 aa  2014    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  65.97 
 
 
962 aa  1346    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  60 
 
 
962 aa  1219    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  59.83 
 
 
960 aa  1204    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  68.55 
 
 
986 aa  1377    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  60.28 
 
 
962 aa  1211    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  64.7 
 
 
962 aa  1270    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  60.46 
 
 
962 aa  1224    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  64.81 
 
 
962 aa  1272    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  67.21 
 
 
982 aa  1376    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  60.21 
 
 
962 aa  1224    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  60.46 
 
 
962 aa  1224    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  36.41 
 
 
946 aa  552  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  32.87 
 
 
958 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  29.9 
 
 
947 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  30.36 
 
 
925 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  30.08 
 
 
929 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  28.32 
 
 
939 aa  365  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  28.04 
 
 
929 aa  363  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  28.2 
 
 
929 aa  362  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  27.98 
 
 
929 aa  361  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  28.62 
 
 
929 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  28.62 
 
 
929 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  28.81 
 
 
929 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  27.87 
 
 
929 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  28.72 
 
 
929 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  28.62 
 
 
929 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  28.25 
 
 
929 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  27.99 
 
 
929 aa  356  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  28.79 
 
 
929 aa  354  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  28 
 
 
929 aa  353  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  28.14 
 
 
968 aa  347  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  27.8 
 
 
925 aa  346  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  27.71 
 
 
929 aa  341  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  27.69 
 
 
941 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  27.21 
 
 
904 aa  328  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  25.7 
 
 
936 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  26.7 
 
 
963 aa  302  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  25.31 
 
 
915 aa  298  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  25.87 
 
 
1074 aa  283  8.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  24.42 
 
 
1100 aa  266  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  24.18 
 
 
945 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  26.55 
 
 
1008 aa  262  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  25.1 
 
 
995 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  25.5 
 
 
1162 aa  253  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  24.05 
 
 
916 aa  243  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  24.03 
 
 
952 aa  224  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  24.1 
 
 
939 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  26.87 
 
 
1272 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  30.83 
 
 
762 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  31.64 
 
 
779 aa  118  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  26.78 
 
 
808 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  28.65 
 
 
775 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  26.24 
 
 
760 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  36.22 
 
 
843 aa  98.6  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  28.11 
 
 
763 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  27.72 
 
 
766 aa  98.2  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  30.53 
 
 
809 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  24.43 
 
 
1246 aa  96.3  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.31 
 
 
766 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  24.52 
 
 
932 aa  93.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  29.49 
 
 
794 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  22.99 
 
 
422 aa  91.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
422 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  28.75 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 
443 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  25.96 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  25.46 
 
 
419 aa  82  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  24.79 
 
 
461 aa  82  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3480  peptidase M16 domain protein  27.54 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  23.55 
 
 
422 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
443 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  22.86 
 
 
431 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  25.45 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  22.82 
 
 
424 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  24.45 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  26.18 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  23.74 
 
 
440 aa  77.4  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
443 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
443 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.41 
 
 
937 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
443 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  22.03 
 
 
418 aa  77.4  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  27.47 
 
 
442 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  23.3 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  27.8 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  23.87 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>