148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2068 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  100 
 
 		 373 aa  764    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  79.89 
 
 		 373 aa  631  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  77.75 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  77.48 
 
 		 373 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  74.26 
 
 		 373 aa  600  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  74.12 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  74.39 
 
 		 373 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  74.12 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  74.12 
 
 		 373 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  73.99 
 
 		 373 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  73.46 
 
 		 373 aa  587  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  74.12 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  74.12 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  74.12 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  73.99 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  74.12 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  74.12 
 
 		 373 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  73.73 
 
 		 373 aa  587  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  73.05 
 
 		 373 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  72.78 
 
 		 373 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  73.05 
 
 		 373 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  73.05 
 
 		 373 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  72.51 
 
 		 373 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  61.13 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  59.79 
 
 		 373 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  60.05 
 
 		 373 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  59.84 
 
 		 373 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  59.84 
 
 		 373 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  59.57 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  58.71 
 
 		 373 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  59.03 
 
 		 373 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  46.17 
 
 		 390 aa  364  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  45.14 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  44.83 
 
 		 375 aa  344  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  43.34 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  43.34 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  43.08 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  43.08 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  45.14 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  45.14 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  42.05 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  45.24 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  45.14 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  45.14 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  43.65 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  43.09 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  41.78 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  41.76 
 
 		 374 aa  315  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  43.12 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  42.86 
 
 		 379 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  43.12 
 
 		 379 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  42.86 
 
 		 379 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  42.86 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  43.67 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  42.38 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  40.99 
 
 		 376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  39.79 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  40 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  40.16 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  39.41 
 
 		 392 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  36.66 
 
 		 388 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  37.01 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  41.04 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  41.18 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  36.9 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  37.07 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  37.33 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  37.04 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  37.04 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  34.57 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  36.63 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  35.54 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  35.81 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  35.71 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  35.95 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  35.95 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  38.63 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  36.65 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  33.93 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  35.73 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  35.45 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  36.72 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  38.31 
 
 		 471 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  35.54 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  39.24 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  33.86 
 
 		 422 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  34.15 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  34.15 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  38.54 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  35.83 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  34.29 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  35.16 
 
 		 401 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  34.29 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  34.15 
 
 		 406 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  33.86 
 
 		 395 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  36.34 
 
 		 406 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  33.97 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  33.7 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  38.6 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>