81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2745 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  100 
 
 		 499 aa  1002    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  40.73 
 
 		 534 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  38.29 
 
 		 554 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  38.76 
 
 		 514 aa  293  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  38.84 
 
 		 685 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  33.22 
 
 		 639 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  32.3 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  27.43 
 
 		 605 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  29.12 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  26.33 
 
 		 821 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  24.81 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  28.29 
 
 		 538 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  30.46 
 
 		 622 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  27.19 
 
 		 539 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  27.58 
 
 		 614 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  25.83 
 
 		 592 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  29.11 
 
 		 635 aa  143  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  30 
 
 		 618 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  28.06 
 
 		 638 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  24.47 
 
 		 592 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  24.88 
 
 		 592 aa  136  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  27.27 
 
 		 570 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  26.86 
 
 		 627 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  28.83 
 
 		 630 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  25.43 
 
 		 581 aa  131  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  30.5 
 
 		 657 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  29.09 
 
 		 521 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  27.43 
 
 		 644 aa  123  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  30.27 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  27.79 
 
 		 606 aa  120  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  26.79 
 
 		 612 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  28.12 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  27.45 
 
 		 640 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  26.34 
 
 		 635 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  26.13 
 
 		 616 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  26.18 
 
 		 608 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  27.63 
 
 		 673 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  28.74 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  24.47 
 
 		 652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  25.12 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  24.06 
 
 		 650 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  29.71 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  27.63 
 
 		 673 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  26.34 
 
 		 683 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  26.67 
 
 		 615 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  27.48 
 
 		 690 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  28.85 
 
 		 612 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  28.37 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  29.83 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  27.55 
 
 		 673 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  29.08 
 
 		 427 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  28.31 
 
 		 679 aa  106  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  27.04 
 
 		 694 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  25 
 
 		 642 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  27.34 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  25.33 
 
 		 647 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  25.45 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  31.12 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  27.1 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  27.1 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  28.06 
 
 		 512 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  28.71 
 
 		 416 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  25.9 
 
 		 627 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  26.52 
 
 		 612 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  26.08 
 
 		 549 aa  96.7  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  27.8 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  27.86 
 
 		 426 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  26.41 
 
 		 540 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.41 
 
 		 540 aa  88.2  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  23.15 
 
 		 647 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  25.06 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.64 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  23.5 
 
 		 541 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  48.84 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  22.7 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.52 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.18 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  51.43 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.69 
 
 		 372 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.67 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.36 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>