255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1962 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  100 
 
 
323 aa  641    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  70.09 
 
 
322 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  60.37 
 
 
323 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  60.12 
 
 
324 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  61.83 
 
 
325 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  64.71 
 
 
321 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  63.52 
 
 
324 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  60.37 
 
 
328 aa  364  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2006  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  58.57 
 
 
324 aa  359  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0509  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  63.19 
 
 
324 aa  353  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  56.83 
 
 
325 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  54.72 
 
 
326 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  49.06 
 
 
326 aa  288  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  50.31 
 
 
323 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  47.87 
 
 
329 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  48.45 
 
 
322 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  44.73 
 
 
320 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.26 
 
 
320 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.79 
 
 
319 aa  258  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.55 
 
 
320 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  44.62 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.33 
 
 
364 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  44.62 
 
 
332 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.03 
 
 
319 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.71 
 
 
319 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0977  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  44.38 
 
 
329 aa  248  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  44.88 
 
 
321 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  45.54 
 
 
321 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.9 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0364  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.79 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.174452  normal  0.286588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  43.48 
 
 
322 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  44.51 
 
 
325 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  45.45 
 
 
318 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3371  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  42.17 
 
 
320 aa  235  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.31 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  42.24 
 
 
321 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  42.55 
 
 
331 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.23 
 
 
324 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.23 
 
 
324 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.23 
 
 
324 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.97 
 
 
321 aa  225  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.01 
 
 
316 aa  222  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.01 
 
 
316 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2013  sodium-calcium exchanger  41.94 
 
 
322 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.01 
 
 
316 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0181  sodium/calcium antiporter family protein  41.94 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.22 
 
 
316 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.24 
 
 
310 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.45 
 
 
314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.45 
 
 
314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.01 
 
 
367 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.45 
 
 
314 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.45 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2224  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.9 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  38.78 
 
 
309 aa  212  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  38.8 
 
 
316 aa  212  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.75 
 
 
310 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.23 
 
 
320 aa  208  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.37 
 
 
357 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.43 
 
 
358 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.06 
 
 
314 aa  202  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.68 
 
 
368 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.14 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.94 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.35 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.25 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.22 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.2 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.33 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.65 
 
 
322 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3575  putative calcium/sodium:proton antiporter  40 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.01 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  40 
 
 
325 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  40 
 
 
325 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.69 
 
 
325 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.69 
 
 
325 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.46 
 
 
357 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.61 
 
 
367 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.8 
 
 
325 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.58 
 
 
357 aa  192  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02649  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  50.26 
 
 
204 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  37.9 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.29 
 
 
358 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  38.49 
 
 
364 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  38.49 
 
 
364 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  37.66 
 
 
361 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.36 
 
 
310 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.62 
 
 
369 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1742  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.38 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0365853  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  33.23 
 
 
331 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  39.02 
 
 
318 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2386  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.68 
 
 
325 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.06 
 
 
312 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  36.1 
 
 
324 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  38.36 
 
 
320 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3684  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.65 
 
 
325 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4518  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.65 
 
 
325 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.449826  normal  0.512048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.65 
 
 
325 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3574  putative calcium/sodium:proton antiporter  38.82 
 
 
325 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  35.56 
 
 
360 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>