202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1139 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 
237 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  47.26 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.21 
 
 
244 aa  230  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  46.22 
 
 
246 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  43.21 
 
 
243 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.68 
 
 
243 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.82 
 
 
255 aa  138  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  35.47 
 
 
258 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.57 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.03 
 
 
302 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  29.38 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  33.33 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  26.92 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  30.9 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  30.9 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  30.98 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  27.27 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  29.25 
 
 
339 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  29.25 
 
 
339 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  29.25 
 
 
339 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.77 
 
 
339 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  28.78 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  28.43 
 
 
245 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.89 
 
 
249 aa  89  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  25.57 
 
 
258 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.9 
 
 
330 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  31.46 
 
 
338 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.51 
 
 
244 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  25.82 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.23 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  30.9 
 
 
338 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.44 
 
 
285 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  30.9 
 
 
340 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.22 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.22 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.22 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  27.94 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.15 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.96 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  28.38 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  27.36 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  29.74 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  28.98 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  26.87 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.89 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  29.13 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  29.41 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  27.87 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  27.87 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  27.41 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.67 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.33 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  27.5 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  25.39 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  26.44 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  30.39 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  29.73 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  30.39 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  25.49 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  28.18 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  28.41 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  29.28 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.6 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  29.84 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  24.87 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.75 
 
 
319 aa  78.6  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.11 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.32 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  26.92 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  26.92 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  27.62 
 
 
282 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  27.62 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  27.62 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  26.94 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  28.18 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  27.62 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  27.62 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.62 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  27.62 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0192  hypothetical protein  29.76 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.64 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  26.34 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  27.91 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.81 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>