More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0467 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  59.59 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  54.66 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  55.14 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  53.04 
 
 		 264 aa  268  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  51.45 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  50.79 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  53.06 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  52.28 
 
 		 302 aa  251  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  52.8 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  51.87 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  52.65 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  49.21 
 
 		 254 aa  248  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  56.61 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  48.96 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  49.01 
 
 		 264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  47.97 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  44.9 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  44.35 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  42.8 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  49.79 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  43.48 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  44.67 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  45.71 
 
 		 272 aa  210  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  46.86 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  46.56 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  42.34 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  41.53 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  45.31 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  47.15 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  46.31 
 
 		 276 aa  204  7e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  44.94 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  42.68 
 
 		 275 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  44.9 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  41.53 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  43.8 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  42.91 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  43.57 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  43.62 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  42.39 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  44.86 
 
 		 278 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  42.68 
 
 		 268 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  41.39 
 
 		 246 aa  194  9e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  44.44 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  44.44 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  42.8 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.67 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  43.72 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  44.4 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  44.4 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  44.4 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  44.4 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  44.4 
 
 		 303 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  42.56 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  43.21 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  43.98 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  43.98 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  43.98 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  40.98 
 
 		 292 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  43.98 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  41.63 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.31 
 
 		 286 aa  187  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  41.56 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  43.8 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  43.21 
 
 		 279 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  40.48 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 279 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  40.16 
 
 		 292 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  42.74 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  41.46 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  44.94 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  38.15 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  43.85 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 359 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.22 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  44.49 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  44.98 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  39.84 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  38.87 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3669  ABC transporter related  44.53 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0691593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  38.87 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>