More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2208 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 267 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1469  TatD-related deoxyribonuclease  76.61 
 
 		 249 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170381  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0939  TatD-related deoxyribonuclease  74.6 
 
 		 249 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6142  TatD-related deoxyribonuclease  45.75 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  43.57 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0664  TatD-related deoxyribonuclease  43.8 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4247  TatD-related deoxyribonuclease  39.33 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.555643  decreased coverage  0.000153731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2167  TatD-related deoxyribonuclease  37.76 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5067  TatD-related deoxyribonuclease  36.99 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3158  TatD-related deoxyribonuclease  36.99 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5210  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2262  TatD-related deoxyribonuclease  37.09 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.225639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22950  Mg-dependent DNase  40.3 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00452809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  35.98 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0618  TatD-related deoxyribonuclease  31.74 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.189255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  31.15 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2029  TatD-related deoxyribonuclease  31.55 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.755342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  28.51 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  28.11 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  28.11 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  32.69 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  32.69 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  34.68 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1030  TatD-related deoxyribonuclease  28.11 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02480  Mg-dependent DNase  29.04 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.03042 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  31.78 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  32.31 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.71 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.31 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  31.64 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  26.8 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  31.89 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  27.31 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  27.31 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  27.31 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  29.52 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.31 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  29.89 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  30.12 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  29.34 
 
 		 464 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  31.8 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  28.46 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  30.12 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  30.62 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  31.64 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  30.53 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  28.29 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  30.62 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  31.64 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  31.64 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  30.53 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  30.53 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  30.53 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.51 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  33.59 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  26.19 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  27.07 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  28.41 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  29.5 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  28.14 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  29.73 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  27.71 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  28.85 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  28.03 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  28.68 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  30.99 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  28.88 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  30 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  31.87 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  28.79 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  33.48 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  30.53 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  30.53 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  29.18 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  30.15 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  32.81 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  27.65 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  32.11 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  30.93 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  29.07 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  31.25 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1040  TatD-related deoxyribonuclease  29.52 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  29.7 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  29.46 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  29.48 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  29.96 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0966  TatD family hydrolase  29.79 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.732355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  30.5 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  29.7 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  25.4 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  27.65 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  29.73 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  27.27 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  28.2 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  25.79 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  33.83 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  30.77 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  32.39 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>