209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5918 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5918  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  100 
 
 		 400 aa  806    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4059  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  75.08 
 
 		 333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0598  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  76.58 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0619  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  76.58 
 
 		 332 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.109735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  49.37 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  53.19 
 
 		 273 aa  296  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  73.1 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  66.89 
 
 		 263 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  57.14 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  46.71 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  50.68 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  54.11 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  50.66 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  52.08 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  42.95 
 
 		 271 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  42.95 
 
 		 271 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  46.71 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  46.1 
 
 		 249 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  44.02 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  43.84 
 
 		 268 aa  119  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  47.74 
 
 		 246 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  46.45 
 
 		 248 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  43.35 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  46.1 
 
 		 246 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  46.58 
 
 		 267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  47.4 
 
 		 248 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  45.16 
 
 		 242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  47.37 
 
 		 252 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  47.3 
 
 		 258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  42.38 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  42.38 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  41.56 
 
 		 269 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1226  hemolysin A  45.51 
 
 		 249 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  47.22 
 
 		 252 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  44.22 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  46.9 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  46.9 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2767  hemolysin A  38.31 
 
 		 240 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000408099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  43.31 
 
 		 253 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  41.06 
 
 		 266 aa  106  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  43.79 
 
 		 264 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  39.58 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1158  hemolysin A  44.44 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  45.89 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  42.66 
 
 		 246 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  44.59 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  48.57 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  46.53 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  42.07 
 
 		 240 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  45.52 
 
 		 271 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  41.72 
 
 		 282 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  42.21 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  45.83 
 
 		 270 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  40.69 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  57.45 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  41.03 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  43.07 
 
 		 268 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  39.61 
 
 		 269 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  41.67 
 
 		 284 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  37.34 
 
 		 271 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  40.14 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  41.38 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  44.53 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  47.59 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  41.1 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  45.58 
 
 		 251 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  41.38 
 
 		 279 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  41.38 
 
 		 279 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  41.38 
 
 		 279 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  41.38 
 
 		 279 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  41.38 
 
 		 279 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  41.38 
 
 		 279 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  38.96 
 
 		 272 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  42.25 
 
 		 277 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  46.76 
 
 		 253 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  44.52 
 
 		 252 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  44 
 
 		 271 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  48.04 
 
 		 262 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  45.14 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  45.14 
 
 		 267 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  46.76 
 
 		 253 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  45.71 
 
 		 253 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  42.57 
 
 		 250 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  43.15 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  44.29 
 
 		 246 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04750  hemolysin A  47.14 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000612241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  41.94 
 
 		 281 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  39.58 
 
 		 270 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  47.33 
 
 		 269 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  39.07 
 
 		 266 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  42.47 
 
 		 250 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  48.61 
 
 		 250 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2697  hemolysin A  44.44 
 
 		 248 aa  97.8  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  44.81 
 
 		 265 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  43.26 
 
 		 252 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  33.33 
 
 		 243 aa  97.4  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  60.67 
 
 		 268 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  41.67 
 
 		 264 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  41.56 
 
 		 268 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  41.94 
 
 		 246 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>