179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5617 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  100 
 
 		 368 aa  750    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  60.61 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  57.01 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  59.93 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  59.93 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  59.87 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  58.28 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  58.6 
 
 		 344 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  58.28 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  58.28 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  58.28 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  58.28 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  42.4 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.67 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  44 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  40.41 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2774  ABC transporter substrate-binding protein  42.67 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4899  ABC transporter substrate-binding protein  42.22 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1329  ABC transporter substrate-binding protein  44.55 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  0.17545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1169  ABC transporter substrate-binding protein  44.55 
 
 		 361 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0939824  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31110  ABC transporter substrate binding protein  42.67 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4839  ABC transporter substrate-binding protein  41.47 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3303  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  42.72 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2686  ABC transporter substrate-binding protein  41.2 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0857  putative nitrate transport protein NrtA  39.33 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  41.67 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  41.72 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  38.1 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1356  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.52 
 
 		 367 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.459208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  31.36 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3147  hypothetical protein  24.67 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  29.3 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0526  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.93 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.23 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  27.48 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  29.13 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0049  putative nitrate transport protein NrtA  26.02 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  23.62 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  25.64 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.3 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.56 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  26.33 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  27.96 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  27.96 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  28.77 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  22.42 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  24.8 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  25.81 
 
 		 341 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  25.43 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.25 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  23.51 
 
 		 475 aa  52.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  24.5 
 
 		 464 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.82 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  30.95 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  24.58 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.47 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  23.4 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  23.48 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  31.8 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.39 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2402  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.55 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.150141  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20.52 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20.52 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7929  ABC transporter substrate binding protein  23.55 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.32 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  31.78 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20.52 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  31.78 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  32.21 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  25.17 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  31.78 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  31.78 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  31.78 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  31.78 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  23.08 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.2 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  38.04 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  24.15 
 
 		 454 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.25 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  27.88 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  25.63 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.25 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  22.33 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.5 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3943  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  28.99 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.93 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>