88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7929 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7929  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 		 335 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6546  ABC transporter substrate-binding protein  68.77 
 
 		 335 aa  454  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280995 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0736  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  63.13 
 
 		 346 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0465  ABC transporter substrate-binding protein  56.51 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16940  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0876467  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2838  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.884222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4507  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.71 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5147  extracellular solute-binding protein family 3  31.71 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2952  NMT1/THI5 like domain protein  26.25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0396  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.92 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.87 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  27.59 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  21.43 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.44 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4569  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.34 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0409  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  25.75 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.830213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.64 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3868  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.96 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  27.09 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2153  putative solute-binding periplasmic protein of ABC transport  27.56 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1260  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  22.8 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  27.55 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  22.71 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0996  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.11 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.822454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.66 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  23.26 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  24.23 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3890  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.59 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3806  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.59 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  28.34 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3749  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.12 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.9 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  23.02 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  20.83 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  23.19 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  39.08 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1958  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.34 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1849  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.34 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1412  hypothetical protein  21.98 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.208559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.13 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.42 
 
 		 383 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  35.83 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0383  NlpA lipoprotein  25.65 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391974  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.62 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  27.62 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0737  hypothetical protein  26.79 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107641  normal  0.209363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  34.15 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  34.48 
 
 		 443 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  24.35 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.64 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  25.93 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.11 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  35.23 
 
 		 437 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1169  taurine ABC transporter periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0330  hypothetical protein  21.12 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0902342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 430 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  24 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  26.19 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3501  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.32 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00652225  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  25.71 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0507  hypothetical protein  19.83 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  34.15 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.4 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  22.76 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1487  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.143655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12920  taurine ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.472759  normal  0.43236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  26.98 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  25.38 
 
 		 475 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1234  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.19 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  34.62 
 
 		 431 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  29.5 
 
 		 415 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  23.28 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  28 
 
 		 442 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  23.9 
 
 		 452 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  25.13 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  24.21 
 
 		 434 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  31.43 
 
 		 450 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  23.68 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1297  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  22.78 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  22.38 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  24.91 
 
 		 344 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>