More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0967 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0967  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  855    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3157  major facilitator superfamily MFS_1  64.8 
 
 		 437 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3970  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  27.91 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  27.67 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  27.67 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  27.46 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2240  putative permease  26.79 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  25.43 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.42 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.1 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 430 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  25 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.84 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  27.71 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  28.25 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.82 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  25 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  28.12 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  22.65 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  22.39 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  22.39 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  25.82 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  26.8 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  25 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  23.48 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38823  MFS family transporter: phosphate/sugar  27.63 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  25.83 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  25 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>