More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0950 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  58.74 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  53.85 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  43.8 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  49.13 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  41.57 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  46.79 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  46.79 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  46.79 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  46.79 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  46.79 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  46.79 
 
 		 301 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  47.58 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  44.96 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  44.04 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  44.49 
 
 		 300 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  44.49 
 
 		 300 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  45.05 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  39.11 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  32.95 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 		 443 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  32.77 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  31.46 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.26 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.64 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.78 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  32.73 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  20.15 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.17 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5478  Alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.16 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.48 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  50.57 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  23.4 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  32.2 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.63 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  27.39 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  25.8 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.96 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  32.4 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>