More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1348 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
312 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
312 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 
311 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.9 
 
 
320 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.48 
 
 
314 aa  208  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.39 
 
 
317 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
311 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
322 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.98 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
287 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
283 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
283 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
276 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  37.5 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.89 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
249 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.03 
 
 
310 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.76 
 
 
193 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.22 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
277 aa  63.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
339 aa  62.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  29.75 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.75 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  35.34 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.94 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  22.78 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  26.01 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  26.52 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
298 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  27.8 
 
 
499 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.7 
 
 
349 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  26.01 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.28 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.94 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  25.54 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  26.44 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  24.33 
 
 
349 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  27.53 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.69 
 
 
299 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 
322 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.62 
 
 
295 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.41 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  50 
 
 
280 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.08 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  41.94 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  31.88 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
334 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
308 aa  52.8  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>