More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0456 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0456  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
531 aa  1069    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1847  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
526 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.068039  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1894  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
526 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.567427  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1828  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
526 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1804  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 
520 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12787  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1823  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 
520 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1870  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 
520 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2323  extracellular solute-binding protein family 5  29.93 
 
 
518 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250322  normal  0.0484761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
521 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
538 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 
528 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  29.45 
 
 
526 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.43 
 
 
531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  32.61 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.19 
 
 
507 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.32 
 
 
509 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
525 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.51 
 
 
532 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.83 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 
534 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
528 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  32.54 
 
 
540 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.49 
 
 
521 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.67 
 
 
521 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.67 
 
 
521 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.67 
 
 
521 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
517 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
527 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 
540 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
521 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.03 
 
 
541 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
523 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 
526 aa  123  9e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  28.53 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.5 
 
 
565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  32.54 
 
 
540 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.49 
 
 
538 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  31.15 
 
 
505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.8 
 
 
532 aa  120  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.8 
 
 
532 aa  120  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
510 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.54 
 
 
535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
520 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
551 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 
589 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 
520 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 
536 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
566 aa  117  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.2 
 
 
526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 
492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.2 
 
 
526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.09 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.77 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.74 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.09 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.16 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.06 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  30.36 
 
 
562 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  23.54 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  23.54 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.54 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  23.54 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.54 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  23.54 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.54 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.01 
 
 
526 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
520 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  27.03 
 
 
523 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 
535 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.71 
 
 
520 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
539 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
510 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
519 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
520 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  26.09 
 
 
566 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
523 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.99 
 
 
516 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
543 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.88 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>