54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2543 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  100 
 
 		 465 aa  965    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  55.97 
 
 		 205 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2151  hypothetical protein  44.51 
 
 		 196 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0276455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3573  hypothetical protein  42.68 
 
 		 207 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  44.44 
 
 		 192 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1162  hypothetical protein  34.03 
 
 		 228 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1371  hypothetical protein  32.9 
 
 		 224 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.695328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  36.45 
 
 		 200 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1090  hypothetical protein  32.26 
 
 		 224 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238616 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  40.29 
 
 		 173 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  32.79 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  37.23 
 
 		 309 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  37.16 
 
 		 195 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  36.05 
 
 		 169 aa  90.9  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  38.81 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  30.5 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  33.54 
 
 		 245 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  31.05 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  34 
 
 		 197 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  27.66 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  29.01 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  32.61 
 
 		 203 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  38.32 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  24.68 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  29.23 
 
 		 190 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  27.88 
 
 		 202 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  28.67 
 
 		 187 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  30.47 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  28.35 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 184 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.71 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  26.95 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  32.54 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 184 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2097  hypothetical protein  31.75 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 561 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  31.9 
 
 		 190 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  26.83 
 
 		 197 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  29.55 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  37.93 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  35.23 
 
 		 600 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  24.82 
 
 		 195 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0821  hypothetical protein  26.17 
 
 		 179 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  32.56 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  27.43 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  28.79 
 
 		 543 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  37.35 
 
 		 306 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  27.34 
 
 		 232 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  32.98 
 
 		 174 aa  46.6  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  26.72 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2312  hypothetical protein  27.41 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  32.26 
 
 		 178 aa  43.9  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  32.93 
 
 		 197 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>