More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2429 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  700    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  41.43 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  37.18 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  33.99 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  30.43 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  29.33 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  30.61 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  30.89 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  27.55 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  28.17 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  28.75 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  30.3 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  30.3 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  29.69 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  29.21 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  29.79 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  30.3 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  30.3 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  30.3 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  30.3 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  31.34 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  30.4 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  29.81 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  28.11 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  30.29 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  29.39 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  30.12 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  27.76 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  27.1 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  27.86 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  25.91 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  30.22 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  25.93 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  27.86 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  28.66 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  27.57 
 
 		 356 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.32 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  20.94 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  20.94 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  20.94 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  20.94 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.02 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  20.95 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.2 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  21.49 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.06 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  22.38 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  22.19 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.67 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  25.16 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  20.62 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  22.15 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  23.99 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  24.53 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  23.84 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  23.78 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  29.3 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.14 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  24.53 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  22.15 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  24.38 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  20.35 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  22.11 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.3 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  22.32 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.87 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  23.71 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.75 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  20.99 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  21.85 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  21.54 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  20.77 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  22.63 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  26.35 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  21.6 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  22.94 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  24.18 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  22.19 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  23.61 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  21.5 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.5 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  20.97 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  21.66 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  20.86 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  20.95 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  22.35 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  23.87 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  24.39 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  22.29 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  20.44 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  20.88 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>