More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1788 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 418 aa  872    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  69.34 
 
 		 420 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.55 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.55 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  49.14 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  44.83 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  44.53 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  41.19 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  38.23 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 		 434 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 		 432 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  32.03 
 
 		 407 aa  216  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  31.63 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 435 aa  206  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.59 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 395 aa  97.8  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.01 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  23.76 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  25.06 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  25.54 
 
 		 435 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  27.15 
 
 		 497 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 		 395 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  29.26 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 502 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  26.15 
 
 		 520 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  26.43 
 
 		 662 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.23 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 752 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1964  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.8 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  25.49 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  24.84 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  25.49 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  27.82 
 
 		 633 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  24.74 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  24.67 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  25 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  25.41 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.98 
 
 		 872 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 650 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  26.49 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.91 
 
 		 1115 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.39 
 
 		 1119 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.81 
 
 		 1115 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.39 
 
 		 927 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.39 
 
 		 1115 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 549 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  23.81 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.71 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.1 
 
 		 1115 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.29 
 
 		 1099 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  23.49 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>