More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1232 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  56.99 
 
 		 572 aa  674    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 576 aa  1171    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  52.71 
 
 		 570 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 606 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 620 aa  324  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 1542 aa  282  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  39.54 
 
 		 624 aa  280  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 610 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.55 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 610 aa  273  8.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  32.69 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 607 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 633 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 1557 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  31.62 
 
 		 564 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.28 
 
 		 1537 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 1538 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.13 
 
 		 610 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 1538 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 564 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 592 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 605 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 553 aa  250  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 562 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 887 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 812 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 824 aa  244  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  33.49 
 
 		 509 aa  239  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 591 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 603 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 590 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 604 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  32.47 
 
 		 592 aa  234  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 603 aa  233  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 918 aa  233  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 605 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 603 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 580 aa  230  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  34.66 
 
 		 824 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  28.49 
 
 		 580 aa  226  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 607 aa  226  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.07 
 
 		 557 aa  225  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 602 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 630 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 604 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 604 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 663 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 604 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 620 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  31.74 
 
 		 551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 825 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 825 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  33 
 
 		 824 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  29.84 
 
 		 702 aa  214  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 596 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  30.07 
 
 		 587 aa  213  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 819 aa  211  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  26.5 
 
 		 811 aa  211  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 590 aa  210  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 594 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.94 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 605 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 903 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.28 
 
 		 614 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.28 
 
 		 598 aa  206  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 826 aa  206  9e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.54 
 
 		 602 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 492 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 		 637 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 647 aa  203  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 601 aa  203  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 649 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.59 
 
 		 597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 625 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 592 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 633 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 612 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 602 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 597 aa  200  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.33 
 
 		 603 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 629 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 		 660 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 602 aa  197  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  24.58 
 
 		 669 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.88 
 
 		 645 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 		 649 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>