More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1949 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1949  ABC transporter related  100 
 
 
531 aa  1048    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.267995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  54.27 
 
 
531 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.03 
 
 
536 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  54.11 
 
 
533 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  54.82 
 
 
537 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  54.24 
 
 
543 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  52.96 
 
 
539 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  54.24 
 
 
543 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  53.41 
 
 
543 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  53.56 
 
 
542 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  54.84 
 
 
532 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  52.77 
 
 
539 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  50.38 
 
 
530 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  52.84 
 
 
541 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  55.26 
 
 
545 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 
527 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  53.66 
 
 
536 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  52.77 
 
 
539 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  53.5 
 
 
542 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  55.82 
 
 
543 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  57.77 
 
 
571 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  52.18 
 
 
542 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  53.54 
 
 
533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 
536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  53.45 
 
 
527 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  54.94 
 
 
527 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  50.67 
 
 
534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  53.45 
 
 
537 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  53.46 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  50.67 
 
 
543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  54.55 
 
 
544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
536 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
536 aa  514  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  54.92 
 
 
542 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  53.22 
 
 
545 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  53.9 
 
 
537 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  56.45 
 
 
530 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  52.76 
 
 
545 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  52.76 
 
 
548 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  51.7 
 
 
553 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  53.14 
 
 
545 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 
545 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.63 
 
 
525 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  54.79 
 
 
532 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  49.81 
 
 
534 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  54.23 
 
 
545 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  55.15 
 
 
537 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  53.26 
 
 
536 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  54.03 
 
 
537 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  52.36 
 
 
531 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  52.99 
 
 
545 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  55.18 
 
 
542 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  54.15 
 
 
559 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  52.99 
 
 
545 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  53.18 
 
 
542 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  50.76 
 
 
541 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  53.63 
 
 
525 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  50.29 
 
 
533 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  53.41 
 
 
535 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  55.18 
 
 
542 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.09 
 
 
530 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 
550 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  56.49 
 
 
539 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  53.44 
 
 
524 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  53.58 
 
 
555 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  51.64 
 
 
556 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  53.66 
 
 
544 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  53.66 
 
 
544 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.99 
 
 
536 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  53.55 
 
 
545 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  53.66 
 
 
544 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  53.42 
 
 
550 aa  498  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  49.43 
 
 
555 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  54.77 
 
 
536 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.32 
 
 
534 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  53.32 
 
 
535 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  52.75 
 
 
547 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  52.47 
 
 
529 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  50.09 
 
 
555 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  52.47 
 
 
529 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 
529 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  52.66 
 
 
529 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  50.66 
 
 
540 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  52.66 
 
 
529 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
529 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  52.27 
 
 
529 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  50.28 
 
 
555 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  50.95 
 
 
540 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  50.85 
 
 
540 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  52.27 
 
 
529 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  51.8 
 
 
544 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  52.85 
 
 
530 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  52.57 
 
 
529 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 
529 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  52.54 
 
 
548 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  50.37 
 
 
540 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  50.38 
 
 
544 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 
543 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2368  glutathione import ATP-binding protein GsiA  52.57 
 
 
529 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0121237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  50.47 
 
 
540 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>