241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1749 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  100 
 
 		 510 aa  1049    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  59.64 
 
 		 509 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  58.58 
 
 		 523 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  57.88 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  56.59 
 
 		 510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  54.3 
 
 		 508 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  56.75 
 
 		 514 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  56.13 
 
 		 514 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  54.1 
 
 		 508 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  55.3 
 
 		 513 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  56.55 
 
 		 514 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  55.11 
 
 		 513 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  54.53 
 
 		 513 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  54.39 
 
 		 523 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  53.33 
 
 		 513 aa  538  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  53.77 
 
 		 523 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  54.96 
 
 		 508 aa  534  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  53.76 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  54.74 
 
 		 519 aa  528  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  52.96 
 
 		 507 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  53.42 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  52.26 
 
 		 508 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  52.65 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  54.47 
 
 		 511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  51.15 
 
 		 533 aa  512  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  51.77 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  51.65 
 
 		 508 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  52.83 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  51.47 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  52.33 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  53.05 
 
 		 507 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  52.73 
 
 		 507 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  51.57 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  54.03 
 
 		 538 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  50.69 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  50.69 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  52.1 
 
 		 501 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  50.87 
 
 		 517 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  50.69 
 
 		 500 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  49.51 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  52.57 
 
 		 507 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  52.57 
 
 		 507 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  52.45 
 
 		 509 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  51.98 
 
 		 507 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  51.08 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  51.9 
 
 		 500 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  50.59 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  51.37 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  51.26 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  50 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  51.3 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  50.1 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  50.4 
 
 		 525 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  51 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  51 
 
 		 507 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  46.2 
 
 		 526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  46.18 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  41.16 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  41.33 
 
 		 498 aa  322  9.000000000000001e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  35.8 
 
 		 496 aa  319  6e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  35.45 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  37.3 
 
 		 496 aa  305  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  37.27 
 
 		 495 aa  303  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  37.27 
 
 		 495 aa  302  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  37.27 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  37.27 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  37.27 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  37.27 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  37.27 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  37.8 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  36.38 
 
 		 512 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  37.07 
 
 		 495 aa  299  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4785  Altronate dehydratase  35.28 
 
 		 551 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  40 
 
 		 516 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  39.68 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  39.02 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  34.85 
 
 		 548 aa  292  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  35.93 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  35.93 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  36.18 
 
 		 495 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  34 
 
 		 550 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  35.57 
 
 		 496 aa  290  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  38.66 
 
 		 533 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  34.52 
 
 		 505 aa  289  8e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  35.32 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4019  Altronate dehydratase  33.52 
 
 		 552 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  38.43 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  35.32 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  35.93 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  35.11 
 
 		 496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  38.66 
 
 		 507 aa  283  6.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  35.43 
 
 		 524 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  35.76 
 
 		 524 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4582  galactarate dehydratase  37.97 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.699937  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4448  galactarate dehydratase  37.97 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1735  Altronate dehydratase  33.77 
 
 		 546 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.969827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5737  Altronate dehydratase  34 
 
 		 551 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0190  D-galactarate dehydratase  37.1 
 
 		 564 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5503  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3398  galactarate dehydratase  35.35 
 
 		 524 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>