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for query gene Csal_0795 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
429 aa  837    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  37.71 
 
 
430 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  42.89 
 
 
434 aa  286  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  40.42 
 
 
428 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  39.38 
 
 
445 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0216  sodium:dicarboxylate symporter  42.47 
 
 
421 aa  268  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.013646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  37.25 
 
 
439 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  42.01 
 
 
417 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  36.1 
 
 
432 aa  260  4e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  36.38 
 
 
432 aa  256  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  37.12 
 
 
440 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  36.57 
 
 
435 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  36.57 
 
 
440 aa  255  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  41.24 
 
 
433 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  37.8 
 
 
424 aa  253  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  36.59 
 
 
433 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 
402 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  36.32 
 
 
449 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  38.2 
 
 
443 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  39.41 
 
 
430 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0099  sodium:dicarboxylate symporter  39.8 
 
 
430 aa  242  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  38.56 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  38.56 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  38.56 
 
 
444 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  38.31 
 
 
444 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  37.44 
 
 
413 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  37.81 
 
 
409 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  34.55 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  36.76 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  38.89 
 
 
439 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  37.66 
 
 
440 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  37.66 
 
 
440 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  37.66 
 
 
440 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  35.6 
 
 
457 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  37.7 
 
 
440 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  36.91 
 
 
437 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  36.87 
 
 
447 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  38.95 
 
 
442 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  37.7 
 
 
437 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  35.76 
 
 
457 aa  229  8e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  35.54 
 
 
434 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  37.43 
 
 
437 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  38.08 
 
 
436 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  35.1 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 
436 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  36.92 
 
 
410 aa  226  7e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.43 
 
 
437 aa  226  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  33.33 
 
 
433 aa  226  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  35.8 
 
 
445 aa  223  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  36.53 
 
 
436 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  36.34 
 
 
449 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  34.84 
 
 
434 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.37 
 
 
434 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  38.25 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  39.39 
 
 
427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  34.59 
 
 
457 aa  216  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  37.14 
 
 
452 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  36.13 
 
 
441 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.39 
 
 
440 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 
416 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  38.52 
 
 
419 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  38.52 
 
 
419 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  36.56 
 
 
445 aa  209  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  38.52 
 
 
419 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  38.52 
 
 
419 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  35.45 
 
 
411 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  35.45 
 
 
411 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.45 
 
 
411 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  35.45 
 
 
411 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  35.44 
 
 
437 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  34.96 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.21 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  37.07 
 
 
438 aa  208  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  33.66 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 
420 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  37.95 
 
 
416 aa  207  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  32.16 
 
 
438 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 
417 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  34.91 
 
 
424 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  35.7 
 
 
448 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  34.72 
 
 
411 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  34.72 
 
 
411 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  33.64 
 
 
444 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  34.92 
 
 
436 aa  206  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  34.72 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  34.07 
 
 
411 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  32.29 
 
 
442 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  32 
 
 
436 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  32 
 
 
436 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  32 
 
 
436 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  32 
 
 
436 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  32.05 
 
 
444 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  32 
 
 
436 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  37.68 
 
 
419 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  32.06 
 
 
444 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 
416 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  37.78 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  38.04 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  37.78 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
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NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  37.34 
 
 
441 aa  200  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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