More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5687 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 124 aa  256  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  51.38 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 123 aa  123  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  50.43 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  50.88 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  49.52 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  51.38 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1782  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.62 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  35.78 
 
 		 125 aa  83.6  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  37.38 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  37.14 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  37.14 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  37.14 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  37.14 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  37.14 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  38.95 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  33.65 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  38.95 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  43 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  42 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  42 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  42 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  42 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  42 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  43.53 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  42 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  42 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  38.32 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  34.26 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  38.32 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  38.32 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  38.32 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  38.32 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  38.32 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  34.38 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  41.11 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  35.79 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  34.38 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  40.78 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  41.05 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  33.01 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  37.38 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  33.02 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  34.74 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  37.38 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  37.38 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>