More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4568 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4568  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 311 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.364074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  42.95 
 
 		 294 aa  258  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  29.11 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  30.6 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  30.6 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  29.85 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  30.6 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  30.6 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  27.85 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  38.46 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  27.22 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  37.61 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  29.3 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  33.93 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  19.05 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0145  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  24.13 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  28.57 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.7 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  36.84 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  33.04 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  33.04 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  33.33 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  36.45 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  30.83 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  30.58 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  31.47 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  31.68 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  30.83 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  29.58 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  31.03 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  30.16 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  28.45 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  31.25 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  22.39 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  33.87 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.84 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  29.17 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  30.36 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  30.36 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  30.36 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  33.33 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.73 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  38.61 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  29.23 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0317  prolyl aminopeptidase  26.45 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.463031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  28.44 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>