More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1723 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 131 aa  275  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  75.94 
 
 		 159 aa  214  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  74.81 
 
 		 134 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  74.81 
 
 		 134 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  72.31 
 
 		 135 aa  207  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  74.02 
 
 		 131 aa  206  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  76 
 
 		 160 aa  205  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 		 131 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 		 133 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 		 133 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 		 133 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 		 133 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  66.92 
 
 		 150 aa  191  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  66.14 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  66.14 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  60.63 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  61.86 
 
 		 121 aa  147  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  54.31 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  146  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  146  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  146  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 122 aa  137  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  53.78 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  48.28 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  53.78 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  53.78 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  33.04 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.05 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  31.09 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  36.36 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  31.3 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  31.3 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.25 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.64 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  32.14 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 327 aa  57.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  33.33 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.94 
 
 		 135 aa  57  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  35.78 
 
 		 187 aa  57  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 131 aa  57  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.46 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  35.78 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  35.78 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  35.78 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  35.78 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  35.78 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  35.78 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  35.78 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  30.43 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>