More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3489 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3489  ABC-3 protein  100 
 
 		 280 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  53.43 
 
 		 278 aa  278  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  48.2 
 
 		 283 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  35 
 
 		 288 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  34.31 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  29.97 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  31.14 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  30.12 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  32.95 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  30.5 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  30.5 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06743  hypothetical protein  31.99 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  32.7 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  30.2 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  32.18 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  29.43 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  29.18 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  33.09 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.75 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  28.79 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  29.57 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  31.94 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.18 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  26.69 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  27.06 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  31.32 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  29.46 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  28.16 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11121  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  28.23 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  30.08 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  30.08 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  29.76 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  28.33 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  27.89 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  31.2 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  28.85 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  28.85 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2388  ABC-3 transporter component  31.3 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  26.82 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  29.13 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  29.6 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  29.84 
 
 		 289 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.69 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  27.92 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  28.57 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  29.77 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  27.59 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  28.8 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  29.55 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  29.73 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  27.24 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  26.99 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  25.86 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  25.98 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  29.26 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  26.98 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  29.18 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.13 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  25.88 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.72 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  27.72 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  25.56 
 
 		 361 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  27.86 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  27.72 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.74 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  24.63 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  25.37 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  29.66 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  32.03 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  29.75 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  27.48 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  29.75 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  29.75 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  26.88 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  27.95 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  26.38 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 339 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  29.46 
 
 		 326 aa  95.5  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  29.02 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  28.27 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  26.67 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>