More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2000 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 550 aa  1130    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  63.95 
 
 		 545 aa  740    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  40.22 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 541 aa  415  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  39.02 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  38.48 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  36.78 
 
 		 535 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  36.45 
 
 		 534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  35.38 
 
 		 542 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  37.12 
 
 		 533 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  38.18 
 
 		 530 aa  326  6e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  37.86 
 
 		 535 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  32.85 
 
 		 538 aa  320  3e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  36.44 
 
 		 534 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  35.16 
 
 		 534 aa  306  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  35.42 
 
 		 544 aa  300  4e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  33.7 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.43 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.43 
 
 		 525 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  31.58 
 
 		 541 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  31.29 
 
 		 537 aa  276  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.75 
 
 		 525 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.75 
 
 		 525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 561 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 		 536 aa  269  8.999999999999999e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 549 aa  266  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  34.43 
 
 		 529 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  34.43 
 
 		 529 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 		 526 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 		 539 aa  262  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 526 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  33.95 
 
 		 529 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  33.81 
 
 		 532 aa  259  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  34.89 
 
 		 532 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 		 535 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 		 536 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.16 
 
 		 543 aa  257  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 		 547 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 532 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.61 
 
 		 537 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  31.52 
 
 		 532 aa  253  6e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 535 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 		 544 aa  253  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  31.45 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  33.67 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  31.41 
 
 		 559 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.71 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.22 
 
 		 536 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  32.45 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.22 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 549 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.5 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.5 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.5 
 
 		 543 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.5 
 
 		 543 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.99 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 533 aa  247  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.04 
 
 		 536 aa  247  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 545 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  31.73 
 
 		 535 aa  246  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.49 
 
 		 545 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  32.36 
 
 		 543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.36 
 
 		 558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.85 
 
 		 536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.36 
 
 		 543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  32.36 
 
 		 543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.36 
 
 		 543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  32.36 
 
 		 558 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.36 
 
 		 558 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  30.9 
 
 		 556 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.36 
 
 		 558 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  31.77 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  32.59 
 
 		 558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  29.11 
 
 		 530 aa  243  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.15 
 
 		 543 aa  243  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  29.66 
 
 		 536 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  30.9 
 
 		 525 aa  243  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  29.66 
 
 		 536 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  31.83 
 
 		 547 aa  243  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 549 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 543 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.22 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 		 543 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 556 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  31.33 
 
 		 535 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 		 549 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  31.42 
 
 		 541 aa  239  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  31.12 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>