246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1347 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  676    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  50.76 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  49.24 
 
 
340 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  48.93 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  50.8 
 
 
332 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  46.34 
 
 
336 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  46.08 
 
 
337 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  46.57 
 
 
335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.57 
 
 
335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  44.91 
 
 
334 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  45.59 
 
 
335 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  44.68 
 
 
335 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.73 
 
 
335 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.43 
 
 
335 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  44.82 
 
 
338 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  44.17 
 
 
336 aa  291  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  46.69 
 
 
325 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  45.31 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.57 
 
 
364 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1474  hypothetical protein  29.74 
 
 
332 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2556  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  28.72 
 
 
365 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0652  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  55.06 
 
 
261 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  21.5 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  26.56 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.09 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  25.1 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  25.99 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  25.51 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.64 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.91 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0494  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.18 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.547109  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1180  putative ABC transporter, periplasmic protein  22.11 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.58 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.03 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.36 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.48 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  22.73 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  25.83 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  23.95 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  24.68 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.84 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  24.79 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  25.21 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  24.46 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  23.72 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  25.21 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  24.79 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  26.35 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  25.85 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  23.23 
 
 
349 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  23.73 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  23.17 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  27.62 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  23.67 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.48 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  26.92 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.02 
 
 
345 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  24.67 
 
 
345 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.86 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.67 
 
 
345 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  26.69 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  23.03 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  23.17 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
915 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  25.32 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.21 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  27.62 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  23.17 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.38 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.11 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  22.52 
 
 
348 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.07 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  23.57 
 
 
334 aa  55.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6301  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.1 
 
 
325 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.78 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  27.16 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.29 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0405  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  29.59 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.63 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.79 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.78 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  25.29 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.79 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.8 
 
 
311 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7380  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.9 
 
 
374 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.99 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.71 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  21.01 
 
 
361 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  23.02 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  26.71 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.7 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>