111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0641 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 335 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  34.57 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  30 
 
 		 478 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  30.52 
 
 		 516 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  32.73 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  32.32 
 
 		 488 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  29.43 
 
 		 498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  28.15 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  27.81 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  28.15 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  29.17 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  27.63 
 
 		 547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 		 486 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  26.35 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  28.81 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  28.28 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  27.71 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  26.79 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 		 489 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 		 500 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  25.76 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  27.63 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  26.5 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  29.7 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  26.87 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 		 511 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  27.17 
 
 		 496 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  27.46 
 
 		 483 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  26.39 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  27.4 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  28.04 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  25.25 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  27.37 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  28.25 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  26.85 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  27.61 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  29.84 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  24.92 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  24.29 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  25.99 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  24.91 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  25.7 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  25.85 
 
 		 487 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  27.84 
 
 		 497 aa  92.4  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  26.5 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  25.49 
 
 		 420 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  25.68 
 
 		 484 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  24.83 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  27.04 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  25.59 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  24.34 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  23.9 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  23.9 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  23.41 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  29.85 
 
 		 658 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  28.22 
 
 		 658 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.79 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  26.91 
 
 		 657 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  26.91 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  26.91 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  26.91 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  26.91 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  26.91 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  26.91 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  22.71 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.61 
 
 		 657 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  23.08 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  26.61 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  26.61 
 
 		 657 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  24.71 
 
 		 675 aa  59.7  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  23.28 
 
 		 872 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1286  phosphoesterase, DHH family protein  25.87 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0419  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  26.07 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  24.6 
 
 		 874 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  26.36 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  25.33 
 
 		 669 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  23.94 
 
 		 652 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  23.94 
 
 		 652 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  23.68 
 
 		 904 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  28.48 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0829  phosphoesterase domain-containing protein  21.81 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  25.75 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  26.75 
 
 		 667 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  21.99 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1946  Inorganic diphosphatase  26.67 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16310  inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase  26.42 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0050927  hitchhiker  0.00150657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.15 
 
 		 669 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.76 
 
 		 877 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  26.38 
 
 		 339 aa  46.2  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4078  Inorganic diphosphatase  26.85 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  24.52 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  24.2 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1998  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.27 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534202  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1362  inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase  25.85 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00890264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1778  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.33 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1463  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  20.99 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  25.31 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  24.5 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>