More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2486 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
232 aa  480  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  72.2 
 
 
254 aa  355  5e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.72 
 
 
233 aa  291  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.39 
 
 
233 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.08 
 
 
232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  56.19 
 
 
234 aa  268  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  60.63 
 
 
233 aa  267  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.94 
 
 
229 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.05 
 
 
218 aa  138  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.07 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  36.24 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.55 
 
 
220 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.38 
 
 
225 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  34.93 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.52 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.13 
 
 
218 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.86 
 
 
231 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  36.2 
 
 
232 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.5 
 
 
456 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  35.1 
 
 
221 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.56 
 
 
201 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
456 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.87 
 
 
223 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30 
 
 
456 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  37.91 
 
 
202 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  32.26 
 
 
227 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  37.91 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  37.91 
 
 
202 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.65 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  35.16 
 
 
224 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  32.84 
 
 
222 aa  99  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  29.11 
 
 
214 aa  98.2  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
226 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  35 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
228 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.02 
 
 
201 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  28.05 
 
 
221 aa  95.9  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.55 
 
 
219 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.99 
 
 
202 aa  95.1  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.85 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  30.89 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  32.69 
 
 
214 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  34.57 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  36.08 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.45 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.9 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.58 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.26 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  30.43 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  34.57 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.67 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.61 
 
 
216 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  32.64 
 
 
235 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  28.49 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 
188 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.69 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.17 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  28.96 
 
 
241 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  29.05 
 
 
246 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 
217 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.07 
 
 
217 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  28 
 
 
228 aa  87  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.69 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.69 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.69 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.14 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.19 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.69 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  31.8 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  26.83 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.07 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.52 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.98 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  33.88 
 
 
188 aa  85.5  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  33.88 
 
 
188 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  33.88 
 
 
188 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
221 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  30.85 
 
 
209 aa  85.5  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  32.49 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.2 
 
 
220 aa  85.1  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.67 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.64 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  30.69 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  32.09 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  26.73 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.21 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  32.43 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  31.61 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.77 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  30.93 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.77 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>