More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1057 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 292 aa  603  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  88.36 
 
 		 292 aa  535  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  80.82 
 
 		 296 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  80.48 
 
 		 313 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  80.14 
 
 		 296 aa  488  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  52.6 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  33.96 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.86 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.73 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0997  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.698305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  43.12 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.95 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.21 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.71 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.18 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.3 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 1012 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  33.96 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.92 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.54 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.15 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  28.93 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.8 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  31.9 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.32 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  33.13 
 
 		 832 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.73 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  27.78 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  25.21 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.01 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.25 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.42 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  34.91 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.88 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  28.69 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  31.45 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.33 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  28.69 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  29.91 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  30.23 
 
 		 1014 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  31.19 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.58 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  26.16 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>