More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0755 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 264 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  49.37 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  47.48 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  37.71 
 
 		 234 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  29.54 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  24.81 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  25.54 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.2 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.79 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  30.83 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  27.33 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.58 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  31.37 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  32.65 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  29.51 
 
 		 200 aa  62  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  30.69 
 
 		 400 aa  62  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.46 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  27.08 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  23.58 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.99 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  33.66 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  33.66 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  25.19 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  32.67 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  24.7 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  34.83 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  30.1 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1085 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  29 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  31.68 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  29.46 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  31.68 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  32.95 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  30.21 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  30 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  24.64 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.16 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  31.68 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  28.71 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.68 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  32 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  30.69 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  28.68 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  28.68 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  28.68 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  41.94 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  41.94 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 540 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  41.94 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  28.21 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  41.94 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>