More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0344 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0344  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 308 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0317  alpha/beta hydrolase fold  72.64 
 
 		 308 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0302  alpha/beta hydrolase fold  70.03 
 
 		 307 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1944  proline iminopeptidase, putative  71.28 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2642  alpha/beta hydrolase fold  70.17 
 
 		 296 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0243  alpha/beta hydrolase fold  71.19 
 
 		 307 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000221777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0591  proline iminopeptidase, putative  62.89 
 
 		 291 aa  387  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0276  alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 		 292 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0185  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 290 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2736  alpha/beta hydrolase fold  50.81 
 
 		 125 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.16 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  22.41 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  24.82 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.39 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  21.95 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  32.77 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  21.68 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  25 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  31.09 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.62 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  32.12 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  31.01 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.23 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  23.1 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.68 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  24.23 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  27.35 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  22.78 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  24.81 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  20.94 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  30.3 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  23.13 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  28.18 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  23.19 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  31.4 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5615  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  32.79 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  29.79 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  27.21 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  32.46 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  25.67 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  32.69 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.21 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  23.28 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  25.17 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  25.17 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>