153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0880 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 		 753 aa  1573    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.18 
 
 		 835 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.32 
 
 		 835 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1199  helicase-like  40.44 
 
 		 460 aa  359  9e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00719413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1192  helicase domain-containing protein  43.79 
 
 		 456 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.26 
 
 		 854 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3060  helicase domain protein  41.71 
 
 		 460 aa  333  8e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0341  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.21 
 
 		 881 aa  321  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.03 
 
 		 883 aa  321  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  43.62 
 
 		 306 aa  251  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3059  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.71 
 
 		 325 aa  244  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.41 
 
 		 330 aa  237  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8236  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.74 
 
 		 311 aa  227  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2267  hypothetical protein  41.1 
 
 		 284 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25 
 
 		 255 aa  75.9  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.07 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.27 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.63 
 
 		 334 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.4 
 
 		 412 aa  63.9  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.16 
 
 		 256 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.55 
 
 		 293 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.55 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.46 
 
 		 416 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  21.89 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  21.89 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.48 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  21.07 
 
 		 1122 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1088 aa  57.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1088 aa  57.4  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.68 
 
 		 396 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  22.89 
 
 		 1088 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.64 
 
 		 597 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  22.59 
 
 		 458 aa  56.6  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.81 
 
 		 330 aa  56.2  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.29 
 
 		 396 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  23.88 
 
 		 1354 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  21.35 
 
 		 1082 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3032  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.57 
 
 		 352 aa  55.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  22.27 
 
 		 1073 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1650  modification methylase BslI  22.57 
 
 		 413 aa  55.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.46 
 
 		 429 aa  54.7  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  26.8 
 
 		 1013 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.74 
 
 		 292 aa  54.3  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  21.81 
 
 		 1082 aa  54.3  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.15 
 
 		 267 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.63 
 
 		 283 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.52 
 
 		 360 aa  53.5  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  22.26 
 
 		 413 aa  53.9  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  21.35 
 
 		 1082 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  22.45 
 
 		 1073 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.48 
 
 		 284 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  22.38 
 
 		 1073 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  21.14 
 
 		 574 aa  53.9  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.79 
 
 		 416 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  20.73 
 
 		 885 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.52 
 
 		 1031 aa  53.5  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  28.08 
 
 		 1080 aa  53.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.37 
 
 		 276 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  20.93 
 
 		 1102 aa  52.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.94 
 
 		 386 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  20.22 
 
 		 451 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 1152 aa  52  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 		 1108 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  27.52 
 
 		 1007 aa  51.6  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  20.79 
 
 		 638 aa  51.6  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.29 
 
 		 293 aa  51.6  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 		 1073 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 1403 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  51.2  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  51.2  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.76 
 
 		 315 aa  51.6  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  27.03 
 
 		 1070 aa  51.2  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  22.06 
 
 		 1006 aa  51.2  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  29.08 
 
 		 1159 aa  50.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  28.75 
 
 		 1078 aa  50.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  26.03 
 
 		 991 aa  50.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  27.88 
 
 		 1063 aa  50.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  27.88 
 
 		 1019 aa  50.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.68 
 
 		 302 aa  50.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  24.94 
 
 		 1134 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.33 
 
 		 917 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  25.4 
 
 		 903 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  38.6 
 
 		 250 aa  50.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.83 
 
 		 1067 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  28.49 
 
 		 1153 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  26.86 
 
 		 463 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  24.93 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  24.93 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  24.93 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2126  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.52 
 
 		 370 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  28.17 
 
 		 1096 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  22.49 
 
 		 1070 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 1110 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  28.06 
 
 		 1068 aa  48.5  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  29.05 
 
 		 1073 aa  48.9  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  26.44 
 
 		 470 aa  48.9  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.59 
 
 		 1227 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  24.93 
 
 		 472 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  39.34 
 
 		 1901 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 		 895 aa  47.8  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>