42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0601 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 333 aa  671    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  31.53 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  25.23 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  23.4 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  22.94 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  24.02 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  25.15 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  25.07 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  23.48 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  22.15 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  20.17 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  23.77 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  28.03 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  21.55 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  26.23 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  21.49 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  22.61 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  21.3 
 
 		 742 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  23.95 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  23.17 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  26.37 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  27.03 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  35.59 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  21.61 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 277 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  24.02 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  23.03 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  25.74 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  19.23 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  25.57 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  22.58 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  23.73 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  22.46 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  27.4 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  22.83 
 
 		 281 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 355 aa  42.7  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>