More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1766 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 220 aa  457  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  65.3 
 
 		 223 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  66.36 
 
 		 223 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  63.93 
 
 		 226 aa  300  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  61.01 
 
 		 223 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  59.09 
 
 		 223 aa  264  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  57.53 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  49.55 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  46.48 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  46.23 
 
 		 212 aa  187  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  46.45 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  45.75 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  44.39 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  42.99 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  45.02 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  46.92 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  43.66 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  43.13 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  42.52 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  43.87 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  43.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  41.67 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  40.28 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  40.28 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  42.65 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  42.13 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  42.13 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  42.59 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  42.06 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  40.65 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  41.2 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  42.72 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 		 226 aa  167  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  41.2 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  41.2 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  41.18 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  37.16 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  37.61 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  39.9 
 
 		 193 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  37.17 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  34.4 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 		 210 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  34.53 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  36.89 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  34.72 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  34.26 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  35.55 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  35.85 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  31.19 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.58 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 274 aa  74.7  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  30.81 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  40.2 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.41 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.7 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  41.35 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  46.58 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.7 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.79 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.31 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  34.71 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  28.38 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  46.75 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  25.85 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  38.46 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  31.84 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  27.95 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  30.27 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>