More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1446 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1446  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0310637  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1751  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.5 
 
 
221 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.5 
 
 
221 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1565  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 
221 aa  234  9e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  36.77 
 
 
547 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1657  nickel import ATP-binding protein NikE  44.91 
 
 
219 aa  155  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0372  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.94 
 
 
323 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  35.68 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  35.24 
 
 
307 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  36.41 
 
 
558 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  37.67 
 
 
332 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  37.67 
 
 
332 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04520  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  34.27 
 
 
604 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.88111  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  37.5 
 
 
248 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  33.63 
 
 
557 aa  145  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4448  ABC transporter related  38.97 
 
 
287 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338055  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  38.89 
 
 
631 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  34.09 
 
 
611 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  38.71 
 
 
629 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  36.28 
 
 
614 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.82 
 
 
327 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  31.51 
 
 
534 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3923  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.27 
 
 
325 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0312174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1120  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.53 
 
 
350 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.667973  decreased coverage  0.00637132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  34.78 
 
 
366 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4733  ABC transporter, ATPase subunit  34.88 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.497706  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  35.81 
 
 
539 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0688  ABC transporter related  45 
 
 
234 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.873107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.55 
 
 
332 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1770  ABC transporter related  45 
 
 
234 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.529989  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 
320 aa  139  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.213688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3497  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 
614 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  32.13 
 
 
348 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0992  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
326 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.663294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1011  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
326 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.289236  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2683  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.82 
 
 
318 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158942  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3024  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  33.63 
 
 
346 aa  138  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 
370 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  36.84 
 
 
530 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5118  putative ABC transporter ATP-binding  32.43 
 
 
325 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583435  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.58 
 
 
617 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  31.44 
 
 
285 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  35.75 
 
 
308 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4370  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.04 
 
 
338 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6140  ABC transporter related  35.45 
 
 
259 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.620446  hitchhiker  0.00957092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  31.56 
 
 
573 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5063  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.74 
 
 
327 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.18 
 
 
332 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.45 
 
 
584 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  33.49 
 
 
549 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  31.65 
 
 
534 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 
308 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  35.75 
 
 
308 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0999  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 
326 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2120  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
249 aa  135  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5630  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  30.67 
 
 
328 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  36.07 
 
 
288 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 
337 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  34.38 
 
 
345 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  33.78 
 
 
612 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  33.64 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  36.97 
 
 
537 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.18 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 
308 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 
308 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 
308 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 
308 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 
308 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  33.49 
 
 
335 aa  134  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  36.41 
 
 
629 aa  134  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
530 aa  134  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  33.48 
 
 
540 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  33.03 
 
 
358 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.74 
 
 
346 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  34.06 
 
 
556 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  33.64 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  33.03 
 
 
358 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  33.48 
 
 
540 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2366  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.03 
 
 
332 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.343189  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1040  ABC transporter related  35.29 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  34.35 
 
 
349 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  33.03 
 
 
358 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  30.14 
 
 
536 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  30.91 
 
 
355 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.17 
 
 
346 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0189  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  33.04 
 
 
540 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  30.04 
 
 
585 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  33.48 
 
 
330 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  33.04 
 
 
540 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  36.44 
 
 
530 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  32.57 
 
 
329 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3967  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420932  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1838  nickel transporter ATP-binding protein NikE  34.42 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  hitchhiker  0.00699569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>