More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04520  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  100 
 
 		 604 aa  1222    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.88111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  36.48 
 
 		 712 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  38.04 
 
 		 565 aa  329  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.86 
 
 		 620 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  34.78 
 
 		 562 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 593 aa  323  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 		 703 aa  321  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  36.17 
 
 		 569 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  35.36 
 
 		 601 aa  319  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 544 aa  318  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  34.75 
 
 		 611 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 541 aa  316  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  34.64 
 
 		 552 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  33.04 
 
 		 578 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  35.87 
 
 		 629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.36 
 
 		 611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  35.32 
 
 		 573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  34.33 
 
 		 619 aa  314  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  36.27 
 
 		 571 aa  313  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 594 aa  312  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  36.13 
 
 		 569 aa  312  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  34.69 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 623 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  32.39 
 
 		 564 aa  311  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  35.69 
 
 		 623 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  34.71 
 
 		 558 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  36.02 
 
 		 619 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 		 711 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 623 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 571 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.22 
 
 		 643 aa  310  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.51 
 
 		 612 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  35.51 
 
 		 612 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 573 aa  309  9e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  36.69 
 
 		 539 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 623 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 623 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  33.56 
 
 		 543 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  35.29 
 
 		 550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 623 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 		 623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  35.91 
 
 		 571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  35.29 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  35.91 
 
 		 555 aa  308  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  37.98 
 
 		 619 aa  307  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  37.89 
 
 		 547 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 562 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.88 
 
 		 626 aa  307  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 		 539 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  35.03 
 
 		 611 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  36.58 
 
 		 544 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  34.35 
 
 		 597 aa  306  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  36.58 
 
 		 544 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  36.58 
 
 		 544 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.33 
 
 		 548 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  35.96 
 
 		 570 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  35.74 
 
 		 563 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  33.51 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 565 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  36.2 
 
 		 586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  36.69 
 
 		 539 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  35.67 
 
 		 562 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.91 
 
 		 568 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4554  ABC transporter related  35.78 
 
 		 670 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  35.47 
 
 		 615 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  35.65 
 
 		 543 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  34.54 
 
 		 561 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  34.96 
 
 		 542 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  34.76 
 
 		 531 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.1 
 
 		 676 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  36.11 
 
 		 545 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  34.89 
 
 		 566 aa  303  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  35.4 
 
 		 544 aa  303  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  35.6 
 
 		 544 aa  303  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  34.4 
 
 		 623 aa  302  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  36.51 
 
 		 539 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  36.5 
 
 		 592 aa  303  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  36.33 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  35.67 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.39 
 
 		 708 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  36.35 
 
 		 547 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  32.92 
 
 		 583 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  34.91 
 
 		 686 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.07 
 
 		 564 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  35.6 
 
 		 613 aa  301  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.06 
 
 		 680 aa  301  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  35.51 
 
 		 545 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.45 
 
 		 617 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  34.75 
 
 		 532 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  33.73 
 
 		 629 aa  300  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  34.08 
 
 		 597 aa  300  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  35.73 
 
 		 551 aa  300  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 623 aa  300  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  34.5 
 
 		 541 aa  300  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 623 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 623 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  34.69 
 
 		 557 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  33.01 
 
 		 627 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>