222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0967 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 390 aa  759    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  33.25 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  31.32 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  31.7 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 421 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  33.17 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  30.32 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  29.78 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  29.89 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  29.82 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  29.78 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  29.79 
 
 		 396 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  29.89 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  29.79 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  28.9 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  28.9 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  27.78 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  29.53 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  29.26 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  28.69 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.64 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  25.71 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  26.48 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  25.52 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  25.71 
 
 		 506 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.45 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  25 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 404 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.66 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 408 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  25.64 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.17 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.04 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  23.93 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  27.59 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  24.73 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  23.61 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  20.32 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  20.67 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0710  putative permease  28.49 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  20.72 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  20.06 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  21.03 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.21 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  26.81 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>