More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0471 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  93.95 
 
 		 432 aa  832    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  93.72 
 
 		 432 aa  831    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  84.83 
 
 		 446 aa  763    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  83.88 
 
 		 431 aa  745    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  93.95 
 
 		 432 aa  833    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  84.37 
 
 		 447 aa  766    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 434 aa  883    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0443  transcription termination factor Rho  81.32 
 
 		 447 aa  726    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0265285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1421  transcription termination factor Rho  83.64 
 
 		 444 aa  744    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  71.63 
 
 		 447 aa  631  1e-180  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  60.44 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  60.68 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  60.77 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  60.34 
 
 		 422 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  60.77 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  60.53 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  60.53 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  58.75 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  59.38 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  59.04 
 
 		 420 aa  501  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  60.24 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  58.77 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  59.86 
 
 		 418 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  59.48 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03719  transcription termination factor Rho  58.75 
 
 		 629 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  60.53 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  60.3 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  59.14 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  59.23 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2158  transcription termination factor Rho  58.03 
 
 		 564 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.156319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  59.13 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  57.98 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  59.13 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  58.57 
 
 		 436 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2806  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0638  transcription termination factor Rho  58.55 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  61.66 
 
 		 548 aa  494  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0795  transcription termination factor Rho  60.82 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.292251  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 420 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  59.13 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  59.23 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  59.13 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 506 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  59.66 
 
 		 418 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  58.89 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1282  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0183251  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 		 421 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  58.55 
 
 		 419 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2118  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299268  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  57.69 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  58.07 
 
 		 418 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2322  transcription termination factor Rho  56.39 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  55.56 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3676  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 583 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  58.89 
 
 		 421 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2135  transcription termination factor Rho  57.49 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173843  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  58.07 
 
 		 418 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  57.04 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  58.22 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  58.21 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 421 aa  485  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.49 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2899  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2638  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105772  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.49 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>