More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0795 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0795  transcription termination factor Rho  100 
 
 
435 aa  881    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.292251  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0137  transcription termination factor Rho  75.59 
 
 
476 aa  648    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0803  transcription termination factor Rho  75.59 
 
 
469 aa  647    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0631326  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0200  transcription termination factor Rho  76.18 
 
 
422 aa  653    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.18497  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0994  transcription termination factor Rho  76.18 
 
 
422 aa  653    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  67.14 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  66.98 
 
 
422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  65.11 
 
 
424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  66.59 
 
 
447 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  66.82 
 
 
506 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  66.43 
 
 
418 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  66.82 
 
 
447 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  67.06 
 
 
421 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  67.06 
 
 
421 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  65.8 
 
 
436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  65.33 
 
 
421 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
428 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  66.82 
 
 
421 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  65.88 
 
 
421 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  66.19 
 
 
418 aa  561  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  64.62 
 
 
421 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  66.82 
 
 
422 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  66.82 
 
 
422 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  65.17 
 
 
418 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  66.82 
 
 
422 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  64.86 
 
 
421 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  65.33 
 
 
436 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  63.24 
 
 
435 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  66.82 
 
 
418 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  65.64 
 
 
421 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  64.39 
 
 
421 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  64.3 
 
 
415 aa  557  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  64.78 
 
 
418 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  65.64 
 
 
421 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  64.62 
 
 
421 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  65.18 
 
 
421 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  64.62 
 
 
421 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  65.65 
 
 
422 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  64.94 
 
 
422 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5019  transcription termination factor Rho  64.62 
 
 
473 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000339489  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  63.98 
 
 
415 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  63.74 
 
 
415 aa  551  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  64.73 
 
 
436 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  63.74 
 
 
415 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  64.93 
 
 
415 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2863  transcription termination factor Rho  64.15 
 
 
423 aa  550  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  61.68 
 
 
437 aa  548  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  64.45 
 
 
415 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  65.17 
 
 
434 aa  549  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  62.56 
 
 
421 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  63.27 
 
 
415 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  63.27 
 
 
415 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  62.56 
 
 
418 aa  541  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  62.8 
 
 
415 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  62.56 
 
 
418 aa  541  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  63.92 
 
 
421 aa  544  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  61.14 
 
 
415 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  61.94 
 
 
431 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  62.17 
 
 
416 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3453  transcription termination factor Rho  62.8 
 
 
423 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  61.14 
 
 
415 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 
503 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  61.05 
 
 
421 aa  531  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  60.81 
 
 
418 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  60.81 
 
 
418 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 
449 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
419 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 
418 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  62 
 
 
419 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
419 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 
419 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 
419 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  60.9 
 
 
414 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
419 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  60.1 
 
 
419 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0512  transcription termination factor Rho  61.05 
 
 
421 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.855654  hitchhiker  0.00605573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0337  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 
421 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
418 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
419 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 
419 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2806  transcription termination factor Rho  59.14 
 
 
420 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  60.81 
 
 
421 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  60.1 
 
 
419 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1282  transcription termination factor Rho  59.1 
 
 
430 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0183251  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4111  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
421 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 
419 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 
419 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03719  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 
629 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2310  transcription termination factor Rho  60 
 
 
432 aa  522  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  normal  0.229849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 
419 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0409  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
421 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
421 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0397  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 
421 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
421 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3189  transcription termination factor Rho  60.28 
 
 
422 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0152106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3676  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 
583 aa  522  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.939305 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  60.66 
 
 
419 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0198  transcription termination factor Rho  63.05 
 
 
402 aa  519  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3434  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 
421 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>