More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0200 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0795  transcription termination factor Rho  76.18 
 
 		 435 aa  653    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.292251  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0137  transcription termination factor Rho  97.63 
 
 		 476 aa  817    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0803  transcription termination factor Rho  97.63 
 
 		 469 aa  815    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0631326  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0200  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 422 aa  854    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.18497  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0994  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 422 aa  854    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  66.27 
 
 		 421 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 		 421 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 		 421 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  65.56 
 
 		 421 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 		 421 aa  574  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  66.83 
 
 		 422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 		 421 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  65.8 
 
 		 421 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  65.56 
 
 		 421 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  66.27 
 
 		 421 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 		 421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 		 422 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  65.08 
 
 		 421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  63.9 
 
 		 418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  65.56 
 
 		 418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  66.35 
 
 		 422 aa  571  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  65.8 
 
 		 421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 		 418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  65.8 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  64.44 
 
 		 447 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  64.44 
 
 		 506 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  65.64 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  64.2 
 
 		 447 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  63.44 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  65.08 
 
 		 436 aa  565  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  64.85 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  64.68 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  64.85 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  62.53 
 
 		 435 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  64.13 
 
 		 418 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  65.08 
 
 		 422 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  63.42 
 
 		 415 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  62.95 
 
 		 418 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  63.72 
 
 		 436 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2863  transcription termination factor Rho  64.61 
 
 		 423 aa  558  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  63.96 
 
 		 436 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  63.1 
 
 		 418 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  64.37 
 
 		 421 aa  555  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  63.1 
 
 		 418 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  64.61 
 
 		 434 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3453  transcription termination factor Rho  63.18 
 
 		 423 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5019  transcription termination factor Rho  62.71 
 
 		 473 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000339489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  61.52 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0198  transcription termination factor Rho  64.69 
 
 		 402 aa  541  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1282  transcription termination factor Rho  59.76 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0183251  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  60.81 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  61.52 
 
 		 419 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  60.86 
 
 		 418 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  60.86 
 
 		 418 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  61.67 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 		 415 aa  534  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 419 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  59.9 
 
 		 450 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  60.62 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  59.9 
 
 		 450 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 		 419 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  61.58 
 
 		 419 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  60.62 
 
 		 419 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  60.38 
 
 		 418 aa  531  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  62.02 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  59.14 
 
 		 484 aa  528  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 420 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  60.62 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 420 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  61.1 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 420 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  61.58 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  62.02 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  62.02 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  59.9 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  62.02 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  61.58 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  61.58 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  60.38 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  61.05 
 
 		 416 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  60.95 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3189  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0152106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  60.71 
 
 		 420 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>