More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3346 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
95 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  56.1 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  49.21 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  45.33 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
197 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
90 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  31.08 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
355 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
107 aa  53.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  48.44 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  41.67 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  32.89 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  32.89 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
124 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  32.89 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
84 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
127 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
112 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  36.71 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
250 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
250 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
250 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.51 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
263 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  43.28 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  32.89 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  39.39 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
103 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
284 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  29.33 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  29.33 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>