More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3142 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 121 aa  240  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  55.21 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  51.92 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  49.51 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  53.54 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  52.04 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  53.33 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  47.22 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  41.07 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  49.43 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  39 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  42.55 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  45.56 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  40.82 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  43.33 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  41.86 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  34 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  41.24 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  33.68 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  43.96 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  42.27 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  38.64 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  40.74 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  40.74 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  38.64 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  40.74 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  42.27 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  41.94 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  39.51 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  39.51 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  40.45 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  36.36 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  36.36 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  41.38 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  35.23 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  40.45 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  43.53 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  36.27 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  36.27 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  35.29 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  35.29 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  35.23 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  35.42 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  42.22 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  39.78 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  42.22 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  34.31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  36.78 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  34.31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  34.31 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>