204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2841 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  96.11 
 
 
719 aa  1444    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
719 aa  1498    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  51.85 
 
 
703 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
365 aa  124  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.18 
 
 
539 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.18 
 
 
539 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  34.23 
 
 
486 aa  121  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  34.65 
 
 
487 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  33.62 
 
 
490 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  36.68 
 
 
389 aa  119  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  34.23 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.48 
 
 
533 aa  114  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  34.69 
 
 
535 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  33.18 
 
 
315 aa  109  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0263  DNA-cytosine methyltransferase  26.05 
 
 
555 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343546  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 
427 aa  99.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
490 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 
483 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 
416 aa  95.9  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.67 
 
 
328 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  27.41 
 
 
406 aa  89.4  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.26 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.94 
 
 
313 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
416 aa  82  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
417 aa  82  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.81 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  22.82 
 
 
310 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
438 aa  80.1  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.57 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.57 
 
 
435 aa  77  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  26.27 
 
 
380 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  26.57 
 
 
350 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.45 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  28.57 
 
 
352 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  31.39 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  24.86 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  30.77 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  25.39 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.6 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 
727 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 
323 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
335 aa  72  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  27.05 
 
 
437 aa  72  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.88 
 
 
424 aa  72  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.98 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.05 
 
 
320 aa  70.5  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  22.91 
 
 
778 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.88 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25.4 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.16 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  25.18 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  25.2 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  25.51 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  31.51 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 
383 aa  67  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  25.79 
 
 
419 aa  67  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.8 
 
 
418 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  25.81 
 
 
323 aa  67  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.8 
 
 
418 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.65 
 
 
335 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 
444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  29.13 
 
 
373 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 
313 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  24 
 
 
336 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 
338 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 
487 aa  66.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  28.19 
 
 
423 aa  65.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
467 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
456 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
456 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.2 
 
 
431 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  32.88 
 
 
375 aa  64.7  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
386 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  28.08 
 
 
657 aa  63.9  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  23.08 
 
 
335 aa  63.9  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
318 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
390 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
407 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.61 
 
 
348 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
387 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.31 
 
 
488 aa  62  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.29 
 
 
409 aa  62  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
417 aa  62  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  25.34 
 
 
462 aa  62  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
415 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>