More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2472 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 570 aa  1172    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  52.71 
 
 		 576 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  49.39 
 
 		 572 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 606 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 620 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  40.21 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 609 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.56 
 
 		 610 aa  286  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 610 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 610 aa  280  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 		 605 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 1557 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 607 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  31.62 
 
 		 564 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  31.29 
 
 		 1537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 1538 aa  270  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.89 
 
 		 610 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 1538 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 1542 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 824 aa  257  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 562 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 592 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 603 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 887 aa  242  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 		 603 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 607 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.7 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 605 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 812 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 592 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 605 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 603 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.73 
 
 		 575 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 591 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  30.87 
 
 		 551 aa  224  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 580 aa  224  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 590 aa  223  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 		 903 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 918 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.89 
 
 		 580 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 601 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  34.02 
 
 		 824 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.29 
 
 		 557 aa  217  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  25.09 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  33.16 
 
 		 824 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 604 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 		 601 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 509 aa  209  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 630 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.42 
 
 		 587 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  30.21 
 
 		 702 aa  204  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 604 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 602 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 605 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.67 
 
 		 602 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 604 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 604 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 826 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  29.67 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 825 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 819 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 602 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 620 aa  198  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 		 633 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 647 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 615 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 825 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 		 605 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.84 
 
 		 606 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  24.08 
 
 		 811 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 616 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 		 609 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 		 649 aa  194  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.47 
 
 		 599 aa  193  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 633 aa  193  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 663 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  25.67 
 
 		 599 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 		 603 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  28.77 
 
 		 611 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 596 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 630 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 		 592 aa  192  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 652 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 637 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 602 aa  189  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 		 597 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 602 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 		 617 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.44 
 
 		 614 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  25.85 
 
 		 649 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 		 601 aa  188  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 		 615 aa  188  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  26.31 
 
 		 661 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>