93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2049 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  40.08 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  28.18 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  32.3 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  27.31 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  29.19 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.27 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  26.9 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  26.84 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  23.68 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  27.11 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  29.19 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30.07 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  27.62 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.4 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.13 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  23.08 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.77 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  26.8 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  26.09 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  24.2 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23.63 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  25.62 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  26.49 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  21.36 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  22.7 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  28.8 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  25 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  25.73 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  23.73 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  26.35 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  28.65 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  24.67 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  22.83 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  25.88 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  24.39 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  22.58 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  24.64 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  26.42 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4148  flagellar assembly protein FliH  24.19 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  27.38 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  25.93 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  24.28 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  20.2 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  23.39 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  25.16 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  26.11 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  22.58 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  24.87 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  23.9 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  18.87 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  25.26 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  25.26 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  28.89 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  24.18 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  28.33 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  25.44 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25.41 
 
 		 334 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  21.83 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  22.5 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  20.45 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  22.99 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1356  flagellar assembly protein H  30.07 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2356  flagellar assembly protein FliH  22.88 
 
 		 200 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.576536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  21.88 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  26.75 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  21.39 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2268  flagellar assembly protein FliH  22.88 
 
 		 200 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  22.5 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  24.53 
 
 		 339 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  24.86 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  27.88 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  21.88 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  25.47 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  25.47 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  24.56 
 
 		 236 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  25.15 
 
 		 228 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  23.27 
 
 		 252 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  25.15 
 
 		 228 aa  42  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  21.88 
 
 		 227 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>